常见细胞污染类型如何辨别及预防解决方法
常见细胞污染类型如何辨别及预防解决方法:细胞培养中常见的生物污染类型有7种,分别是细菌污染,支原体污染,原虫污染,黑胶虫污染,真菌污染,病毒污染以及非细胞污染,真菌污染来源,一般是来自实验服,并且具有气候性,多雨······
发布时间:2025-02-26 21:39:17 细胞资源库平台 访问量:50
乙肝病毒(HBV)感染是全球主要公共卫生问题之一,有超过2.5亿人慢性感染HBV。而其中有超三分之一的人口集中在我国,人数接近1亿人。NTCP工具细胞,特别是外源表达NTCP的肝癌细胞系如HepG2-NTCP和Huh7-NTCP,因其易操作、短周期、重现性佳的特点,在乙肝病毒(HBV)研究中扮演着至关重要的角色。这些细胞模型能够有效模拟HBV的感染过程,为研究HBV的生命周期、宿主限制因子、病毒复制以及药物筛选提供了一个强大而便捷的体外平台。它们不仅有助于揭示HBV感染的分子机制,如DDX3作为宿主限制因子阻碍cccDNA转录,GPC5作为附着因子在感染入胞过程中的作用,还能通过直接与NTCP相互作用或下调NTCP表达来筛选和验证抗病毒药物的活性,例如环孢菌素A及其衍生物、雷帕霉素及其衍生物等。此外,这些工具细胞还促进了对HBV宿主特异性分子的发现,为发展支持HBV感染的小动物模型提供了可能,这对于乙肝相关研究和药物开发具有重大意义。
英文标题:Elevated NTCP expression by an iPSC-derived human hepatocyte maintenance medium enhances HBV infection in NTCP-reconstructed HepG2 cells.
中文标题:通过人源iPSC来源的肝细胞维持培养基提高NTCP重构的HepG2细胞中HBV感染。
发表期刊:《Cell & Bioscience》
影响因子:6.1
作者单位:
Center for Vaccines and Immunity, The Abigail Wexner Research Institute
at Nationwide Children’s Hospital, Columbus, OH 43205, USA.
作者信息:
Xinlei Li, Zhaohui Xu, Bidisha Mitra, Minghang Wang, Haitao Guo, Zongdi Feng.
NTCP是HBV的关键受体,重构的HepG2-NTCP肝癌细胞支持HBV感染但效率不高,未观察到病毒扩散。全球约有2.57亿慢性HBV感染者,但现有抗病毒药物无法根除病毒。HBV是一种有包膜的病毒,含有约3200个核苷酸的松弛环状DNA基因组。由于缺乏有效的细胞培养系统和动物模型,新药物和治疗方法的发展受限。NTCP表达在增殖或再生的肝细胞中难以维持高水平。
HepG2-NTCP细胞在含有10% FBS、1%青霉素和链霉素以及8 μg/ml blasticidin的DMEM培养基中培养,而HBV颗粒则从HepDE19细胞培养上清中收集。在试剂方面,HepG2和HepG2-NTCP细胞使用TaKaRa Bio USA提供的Hepatocyte maintenance medium (HMM)进行预处理或长期培养,NTCP抗体则由瑞士苏黎世大学化学和应用生物科学系的Bruno Stieger博士提供。在HBV感染实验中,HepG2或HepG2-NTCP细胞在接种HBV前24小时用HMM预处理,感染后更换为HMM或D10/2%DMSO培养基。免疫荧光染色方面,不同时间点感染的细胞用4%多聚甲醛固定后,经过封闭、渗透、特异性一抗和二抗染色、DAPI复染,并在显微镜下观察。RNA-Seq分析中,HepG2-NTCP细胞用D10/2%DMSO或HMM预处理24小时后提取总RNA,去除rRNA后获得mRNA片段和cDNA,建库并在Illumina HiSeq 4000平台上产生6000万对端读长150 bp的测序数据。最后,使用DAVID程序对差异表达基因进行基因本体(GO)分析,并利用KEGG数据库理解高级生物功能和通路。
图1. 肝细胞维持培养基(HMM)增强了HepG2-NTCP细胞中的乙型肝炎病毒(HBV)感染。
首先,HepG2-NTCP细胞用100或500基因组当量(GE)/细胞的HBV在含有4%聚乙二醇8000(PEG8000)的DMEM或HMM中稀释,并在有无10 μM环孢素A(CsA)的情况下接种。16小时后,移除接种液,细胞被洗涤并重新用含有10% FBS和2% DMSO的DMEM(D10/2% DMSO)或HMM培养。接种后10天,细胞被固定,并使用抗HBc抗体进行免疫荧光染色。细胞核用DAPI染色。其次,HMM在HBV接种前、中或后被加入到HepG2-NTCP细胞培养中(100 GE/细胞)。接种后10天(B)或8天(C),细胞被固定并用抗HBc抗体染色。比例尺=50 μm。使用NIH的ImageJ软件对HBV感染区域进行量化,并将数据标准化为在常规培养基(D10/2% DMSO)中用100 GE/细胞的HBV感染的培养值,并以两个独立实验的平均值±标准误差呈现。
图2. 肝细胞维持培养基(HMM)处理诱导异位NTCP表达。
A. 在D10/2%DMSO培养基或HMM中培养24或72小时后,通过实时定量PCR(RT-qPCR)检测HepG2和HepG2-NTCP细胞中NTCP mRNA水平。未处理的D10培养基不含2% DMSO。
B. 在指定培养基中培养24、48或72小时后,HepG2-NTCP或亲本HepG2细胞中NTCP蛋白表达的免疫荧光图像。原代肝细胞维持培养基(PMM)含有10% FBS、1%青霉素/链霉素、0.17 μM人类胰岛素、10 μM氢化可的松21-半琥珀酸盐和1.8% DMSO。
C. HepG2-NTCP细胞在接种HBV(500 GE/细胞)前未感染或用HMM或PMM预处理16小时,然后在含有4% PEG 8000的PMM中接种HBV 24小时。移除HBV接种液后,细胞在PMM中维持7天。
D. 在HBV感染后10天,不同HepG2-NTCP克隆中NTCP、HBc(红色)和HBs(绿色)的表达。本研究中大多数实验使用了克隆12。
E. HepG2-NTCP细胞转染含有CMV-IE启动子或EF1α启动子控制的GFP编码质粒后,在指定培养基中培养指定时间的GFP表达。比例尺=50 μm。
图3. 经过HMM处理的HepG2-NTCP细胞的转录组分析显示,HMM或D10/2%DMSO培养基(对照组)处理24小时后,共鉴定出2727个差异表达基因(DEGs),包括1310个上调和1417个下调的DEGs。
与对照组相比,HMM处理组中NTCP的表达增加了6.4倍。KEGG通路分析显示,HMM激活的前三条通路包括代谢途径、神经活性配体-受体相互作用以及细胞因子-细胞因子受体相互作用。HMM还增强了HepG2-NTCP细胞中的代谢活动,这通过与成熟肝细胞功能相关的KEGG通路得到证实,包括脂质代谢、氨基酸合成和外源物质代谢。相比之下,下调的DEGs最丰富的通路包括酒精中毒、癌症途径和系统性红斑狼疮。在162个与HBV相关的基因(KEGG通路hsa05161)中,上调的基因包括SOS1、SLC10A1(NTCP)、STAT4和FASLG;而下调的基因有17个,其中TNF、MAP2K6、E2F1和CCNE2下调最为显著。值得注意的是,TNF能够通过破坏病毒衣壳的完整性来抑制HBV复制,而E2F1或CCNE2的下调可能导致细胞周期停滞,这可能有利于HBV复制。然而,由于HMM对HBcAg和HBsAg表达的最大效应是在HBV接种前添加HMM实现的,通过NTCP上调增加HBV进入似乎是HMM增强HBV感染的主要机制。
图4. HMM与PEG的组合并未导致HepG2-NTCP细胞中HBV的传播。
在HBV感染前,HepG2-NTCP细胞先用HMM或D10/2%DMSO预处理24小时。接种液移除后,细胞随后在HMM或D10/2%DMSO培养基中单独培养或补充4% PEG8000,培养5或10天。通过使用HBc抗体的免疫荧光测定HBV感染率。比例尺=50 μm。
商业肝细胞维持培养基(HMM)在接种乙型肝炎病毒(HBV)前24小时的短期处理能显著提高HBV对NTCP重构的HepG2细胞的感染效率,这一效果是通过增强CMV启动子驱动的NTCP表达实现的。不同克隆的HepG2-NTCP细胞以及不同批次的HMM均显示出一致的效果,表明该方法也适用于其他使用CMV启动子驱动NTCP重构的细胞培养系统。HMM能快速诱导HepG2-NTCP细胞中NTCP的表达,但长期培养并不会导致NTCP表达的进一步增加。尽管HMM激活了多种代谢途径,但其如何增强CMV IE启动子活性的具体机制尚不清楚,需要进一步研究以确定HMM中提高NTCP表达和HBV感染的活性成分。这项研究提供了一个简单有效的方法,显著改善了NTCP重构的HepG2细胞中HBV的感染,为HBV的基础和抗病毒研究开辟了新途径。
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