常见细胞污染类型如何辨别及预防解决方法
常见细胞污染类型如何辨别及预防解决方法:细胞培养中常见的生物污染类型有7种,分别是细菌污染,支原体污染,原虫污染,黑胶虫污染,真菌污染,病毒污染以及非细胞污染,真菌污染来源,一般是来自实验服,并且具有气候性,多雨······
发布时间:2025-02-16 11:01:18 细胞资源库平台 访问量:180
英文标题:Low-dose metformin targets the lysosomal AMPK pathway through PEN2
中文标题:低剂量二甲双胍通过PEN2靶向溶酶体AMPK通路
发表期刊:《Nature》
影响因子:64.8
作者单位:厦门大学
作者信息:林圣彩院士团队、邓贤明团队
二甲双胍是治疗2型糖尿病的常用药物,具有抗衰老和抗癌的潜力。虽然AMPK在二甲双胍的作用机制中起重要作用,但其直接分子靶点尚未明确。
探讨二甲双胍在临床相关浓度下如何激活AMPK,以及其对细胞内AMP水平的影响。
研究者使用了多种细胞模型和生化分析方法,包括Western blot、酶活测定、细胞代谢分析等,以研究二甲双胍对溶酶体v-ATPase的抑制作用及其对AMPK激活的影响。
研究发现,二甲双胍在临床相关浓度下通过抑制溶酶体质子泵v-ATPase来激活AMPK,而不影响细胞内的AMP水平。这表明二甲双胍的作用机制可能涉及溶酶体功能的调节。
本研究揭示了二甲双胍通过抑制溶酶体质子泵v-ATPase来激活AMPK的新机制,为理解二甲双胍的生物学效应提供了新的视角,并为开发新的治疗策略提供了潜在的靶点。
微阵列基因表达谱 从GEO数据库中检索到与心肌I/R损伤相关的mRNA数据集GSE4105和miRNA数据集GSE50885。构建了小鼠心肌I/R损伤模型,并对心肌组织进行了circRNA测序。
小鼠心肌I/R损伤模型的建立 使用了104只雄性C57BL/6小鼠,其中88只用于构建心肌I/R损伤模型,76只建模成功,其余16只进行了假手术。
心肌组织circRNA测序 建立了两个小鼠心肌I/R损伤模型用于测序,并使用两个正常心脏样本作为对照。
心脏功能指数测定 建模后7天,通过超声检测小鼠的心脏功能指数。
Evans Blue/TTC双重染色 通过Evans Blue/TTC双重染色来确定心肌缺血和梗死的面积。
HE染色 对石蜡包埋的心肌组织进行HE染色,以观察组织结构。
透射电镜(TEM) 使用透射电镜观察小鼠心肌组织的超微结构。
H/R细胞模型的开发和细胞处理 从1-2天大的C57BL/6小鼠中分离出心肌细胞,并在缺氧/复氧条件下处理。
免疫荧光检测 通过免疫荧光检测LC3荧光斑点的数量和分布。
Hoechst 33258染色 使用Hoechst 33258染色来观察细胞核形态。
双荧光素酶报告基因检测 通过双荧光素酶报告基因检测来验证circ_ZNF512和miR-181d-5p之间的结合。
细胞质/核分离试验 使用PARIS试剂盒分离细胞质和核成分。
RIP实验 使用RIP试剂盒来分析circ_ZNF512/miR-181d-5p和Ago2的结合。
RNA下拉实验 通过RNA下拉实验来检测circ_ZNF512的富集。
RNA分离和定量 从心肌组织和细胞中分离并定量总RNA。
Western Blot分析 通过Western Blot分析来检测蛋白表达。
图1:二甲双胍通过不增加AMP/ADP水平激活AMPK。
a. 在小鼠原代肝细胞中,低剂量二甲双胍使溶酶体去酸化(左)。细胞用5μM二甲双胍(Met)处理2小时,Lysosensor的相对荧光强度如右图所示。
b. 二甲双胍不会增加小鼠原代肝细胞中的AMP/ADP水平。细胞用5μM二甲双胍处理指定时间后,通过免疫印迹(IB;左)分析磷酸化的(p)-AMPKα和p-ACC,通过质谱法(底部右)分析AMP/ATP和ADP/ATP比率,AMP、ADP和ATP的绝对浓度。用PBS洗涤三次后,通过质谱法(顶部右)测量细胞内二甲双胍浓度(conc.)。有关凝胶源数据,请参见补充图1。数据为均值 ± 标准误差,n值在每个面板上都有标记。P值使用双侧Mann–Whitney检验(a)或单因素方差分析(ANOVA)后进行Tukey检验(b,底部右)或Sidak检验(b,顶部右)计算。a中的实验进行了三次,b中的实验进行了五次。
低剂量二甲双胍能够使小鼠原代肝细胞中的溶酶体去酸化。
二甲双胍处理后,通过免疫印迹检测到磷酸化的AMPKα和p-ACC水平增加,表明AMPK被激活。
质谱分析显示,二甲双胍处理后,细胞内的AMP/ATP和ADP/ATP比率没有显著变化,AMP、ADP和ATP的绝对浓度也没有增加。
实验结果表明,二甲双胍通过不增加AMP/ADP水平来激活AMPK。
本研究中的实验重复次数分别为a部分三次,b部分五次,以确保数据的可靠性。
图2:PEN2与二甲双胍结合,并且是低剂量二甲双胍诱导的AMPK激活所必需的
a. 一个示意图,展示了使用光活性二甲双胍探针(Met-P)从纯化自MEFs的溶酶体蛋白提取物中识别二甲双胍靶点的亲和力为基础的方法。MS,质谱。
b, c. Pen2基因敲除阻断了低剂量二甲双胍激活的AMPK。小鼠原代肝细胞(b)和MEFs(c;克隆1,除非另有说明,否则后续均为此克隆)分别用5μM和200μM二甲双胍处理2小时和12小时,然后分析p-AMPKα和p-ACC。WT,野生型。
d, e. MEFs的STORM图像(d)和HEK293T细胞的TEM图像(e)显示PEN2的一部分定位于溶酶体(e,黑色箭头),并与溶酶体标记物LAMP2(d)重叠。
f, g. PEN2能够与二甲双胍结合。f, 在SPR测定中,PEN2与指定浓度的二甲双胍孵育。g, 在Met-P1结合测定中,转染PEN2或PEN2-2A的HEK293T细胞被裂解,与10μM Met-P1孵育,然后生物素化,接着进行生物素化蛋白质的亲和力沉淀(AP)。
h. PEN2-2A不介导二甲双胍激活的AMPK。Pen2–/– MEFs重新引入了带有HA标签的PEN2-2A,用200μM二甲双胍处理12小时,然后分析p-AMPKα和p-ACC。有关凝胶源数据,请参见补充图1。本图中的实验进行了三次,除了b和c,它们进行了四次。
通过亲和力方法,使用光活性二甲双胍探针(Met-P)从MEFs的溶酶体蛋白提取物中鉴定出二甲双胍的靶点,并通过质谱进行确认。
在小鼠原代肝细胞和MEFs中,Pen2基因敲除后,低剂量二甲双胍无法激活AMPK,表明PEN2在二甲双胍激活AMPK中起关键作用。
STORM和TEM图像显示,PEN2在MEFs和HEK293T细胞中部分定位于溶酶体,并与溶酶体标记物LAMP2重叠。
SPR和Met-P1结合测定表明,PEN2能够与二甲双胍结合。
在Pen2–/– MEFs中重新引入PEN2-2A后,二甲双胍无法激活AMPK,说明PEN2-2A不介导二甲双胍的AMPK激活作用。
本图中的实验重复次数为三次,除了b和c部分进行了四次,以确保结果的可靠性。
图3:ATP6AP1将PEN2与v-ATPase连接起来以激活AMPK
a–c. 通过免疫共沉淀(IP)和免疫印迹(IB)确定ATP6AP1是PEN2的相互作用蛋白。a, 在表达HA–PEN2或Myc–ATP6AP1的HEK293T细胞裂解物中孵育10μM二甲双胍,然后进行PEN2和AP1蛋白的免疫共沉淀。b, c, 分别在野生型MEFs、Pen2–/– MEFs或Atp6ap1–/– MEFs的裂解物中孵育10μM二甲双胍,然后进行PEN2和AP1蛋白的免疫共沉淀。
d. 二甲双胍不促进ATP6AP1与PEN2-20A之间的相互作用。转染HA标签的PEN2或PEN2-20A的HEK293T细胞裂解物按照a中的方法处理,然后通过IP和IB分析ATP6AP1与PEN2的相互作用。
e–i. 失去PEN2–ATP6AP1相互作用会废除二甲双胍对AMPK激活的影响。e, 在Atp6ap1–/– MEFs中重新引入ATP6AP1Δ420–40,f, 在Pen2–/– MEFs中重新引入PEN2-20A突变体,然后用200μM二甲双胍处理12小时,随后分析p-AMPK和p-ACC。g–i, 分析了ATP6AP1和PEN2突变体对AXIN向溶酶体转运(g)以及AXIN为基础的复合物形成(h, i)的影响。Concanamycin A(conA;5μM,2小时)用作对照。FL,全长。
j. 一个示意图,展示了二甲双胍–PEN2–ATP6AP1和FBP–醛缩酶轴构成两条汇合到v-ATPase的输入分流,通过溶酶体途径引发AMPK激活。有关凝胶源数据,请参见补充图1。数据为均值 ± 标准误差,n值在每个面板上都有标记,P值使用双侧Student’s t检验(a,针对Myc–ATP6AP1)、双侧Student’s t检验带Welch’s校正(a,针对HA–PEN2)或双向ANOVA,随后进行Tukey’s检验(g)计算。本图中的实验进行了三次,除了a部分进行了四次,h和i部分进行了五次。
通过免疫共沉淀和免疫印迹技术,确定了ATP6AP1是PEN2的相互作用蛋白,并且这种相互作用在二甲双胍处理后增强。
二甲双胍不促进ATP6AP1与PEN2-20A之间的相互作用,表明PEN2的特定区域对于与ATP6AP1的结合是必要的。
在Atp6ap1–/– MEFs中重新引入ATP6AP1Δ420–440突变体,以及在Pen2–/– MEFs中重新引入PEN2-20A突变体后,二甲双胍无法激活AMPK,说明PEN2–ATP6AP1相互作用对于二甲双胍激活AMPK是必需的。
分析了ATP6AP1和PEN2突变体对AXIN向溶酶体转运以及AXIN为基础的复合物形成的影响,发现这些过程受到PEN2–ATP6AP1相互作用的影响。
提出了一个模型,说明二甲双胍通过与PEN2结合,进而与ATP6AP相互作用,最终通过溶酶体途径激活AMPK。
本图中的实验重复次数为三次,除了a部分进行了四次,h和i部分进行了五次,以确保结果的可靠性。
图4:PEN2和ATP6AP1是二甲双胍生物效应所必需的
a, b. 肠道PEN2对于二甲双胍诱导的血糖降低效应是必需的。PEN2-IKO小鼠按照扩展数据图12d所示给予二甲双胍。然后进行口服葡萄糖耐量测试分析(a)、测量十二指肠二甲双胍浓度(b,左)以及在葡萄糖灌胃前后的血浆GLP-1水平测量(b,右)。
c, d. PEN2对于二甲双胍诱导的肝脏脂肪减少是必需的。在肝脏中特异性敲除Pen2的小鼠按照扩展数据图12f所示给予二甲双胍。在二甲双胍治疗16周后,显示小鼠的腹腔内葡萄糖耐量测试结果(c)和肝脏TAG水平(d)。
e, f. ATP6AP1对于二甲双胍诱导的肝脏脂肪减少是必需的。小鼠按照扩展数据图12m所示给予二甲双胍。在二甲双胍治疗16周后,显示小鼠的腹腔内葡萄糖耐量测试结果(e)和肝脏TAG水平(f)。
g, h. PEN2和ATP6AP1是二甲双胍诱导的寿命延长所必需的。用siRNA敲低pen-2(T28D6.9)的WT(N2)线虫(g)或表达全长ATP6AP1或ATP6AP1Δ420–440的ATP6AP1–/–(vha-19)线虫(h)用50 mM二甲双胍处理。寿命数据以Kaplan–Meier曲线显示(统计分析见补充表3)。Ctrl,对照。
i, j. PEN2和ATP6AP1是饮食中0.1%二甲双胍诱导的AMPK激活所必需的。5周龄的PEN2-LKO小鼠(i;4周龄时注射他莫昔芬)或8周龄的表达ATP6AP1Δ420–440的ATP6AP1-LKO小鼠(j;4周龄时注射病毒,5周龄时注射他莫昔芬)按照之前描述的方法10给予含有0.1%二甲双胍的正常饲料1周。然后通过免疫印迹分析肝脏AMPK激活。有关凝胶源数据,请参见补充图1。数据以均值 ± 标准误差显示,n值在每个面板上都有标记,P值使用双向重复测量ANOVA,随后进行Tukey’s检验(a, c和e比较WT/ATP6AP1-FL + Met组和PEN2-IKO/LKO/ATP6AP1Δ420–440 + Met组在每个时间点的血糖水平;另见a, c和e的插图中的接收者操作特征曲线(AUC)值,以及使用双向ANOVA,随后进行Tukey’s检验的P值),双侧Student’s t检验(b,左),以及双向ANOVA,随后进行Tukey’s检验(b的右图板,以及d, f)。本图中的实验进行了三次。
肠道PEN2对于二甲双胍诱导的血糖降低效应是必需的,PEN2-IKO小鼠在给予二甲双胍后血糖降低效果减弱。
PEN2对于二甲双胍诱导的肝脏脂肪减少是必需的,肝脏特异性敲除Pen2的小鼠在给予二甲双胍后肝脏脂肪减少效果减弱。
ATP6AP1对于二甲双胍诱导的肝脏脂肪减少是必需的,ATP6AP1–/–小鼠在给予二甲双胍后肝脏脂肪减少效果减弱。
PEN2和ATP6AP1是二甲双胍诱导的寿命延长所必需的,敲低pen-2或ATP6AP1–/–的线虫在给予二甲双胍后寿命延长效果减弱。
PEN2和ATP6AP1是饮食中0.1%二甲双胍诱导的AMPK激活所必需的,PEN2-LKO和ATP6AP1-LKO小鼠在给予含有0.1%二甲双胍的饲料后肝脏AMPK激活效果减弱。
本图中的实验重复次数为三次,以确保结果的可靠性。
PEN2是二甲双胍的靶点,通过与ATP6AP1结合抑制v-ATPase的活性,激活溶酶体AMPK,从而实现二甲双胍的有益效应。
PEN2-ATP6AP1轴与溶酶体v-Pase-AXIN-AMPK轴相交,使低浓度的二甲双胍能够利用AMP独立的AMPK激活途径,类似于葡萄糖饥饿或卡路里限制。
PEN2-ATP6AP1轴对于二甲双胍的三大有益效应——餐后血糖降低、肝脏脂肪减少和寿命延长——是必需的,这些效应严格依赖于AMPK。
二甲双胍通过促进肠道GLP-1的分泌以依赖AMPK的方式降低血糖,但低剂量的二甲双胍不抑制肝脏糖异生。
PEN2-ATP6AP1轴还参与二甲双胍抑制mTORC1信号传导,但mTORC1的抑制不涉及由AMPK介导的有益效应。
二甲双胍信号与溶酶体AMPK途径的交叉,而不干扰AMP/ADP水平,可能是二甲双胍具有许多益处而副作用较少的原因。
PEN2-ATP6AP1轴为筛选二甲双胍的替代品提供了潜在目标,这可能适用于更广泛的组织,如肌肉,从而在治疗糖尿病和其他代谢疾病方面产生更好的疗效。
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