常见细胞污染类型如何辨别及预防解决方法
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发布时间:2025-08-19 17:45:30 细胞资源库平台 访问量:13
黑色素瘤作为一种高侵袭性恶性肿瘤,晚期治疗手段有限,亟需新的治疗靶点。载脂蛋白 L3(APOL3)作为与抗原呈递相关的免疫调节蛋白,近年被发现可能参与肿瘤免疫,但在黑色素瘤中的作用尚不明确。在此背景下,来自广州医科大学第五附属医院的 Xinke Zhou、Zesen Mai 团队在《Autoimmunity》(2025, 58 (1):2531833)发表研究,通过生物信息学分析、细胞实验及动物模型,首次证实 APOL3 可通过促进抗肿瘤 T 细胞免疫,抑制黑色素瘤细胞增殖、迁移,并减少肿瘤生长;APOL3 高表达与患者预后良好相关,且与免疫检查点分子及 T 细胞浸润密切相关,为黑色素瘤的免疫治疗提供了新靶点和机制依据。
本研究旨在探究 APOL3 在黑色素瘤中的作用及机制。通过分析 TCGA-SKCM 及 GEO 数据库中黑色素瘤患者的转录组和临床数据,结合共识聚类、生存分析筛选出抗原呈递相关关键基因 APOL3;采用 CCK-8、EdU、Transwell 等实验检测 APOL3 对黑色素瘤细胞(A375、A2058)增殖、迁移和侵袭的影响;利用 B16 黑色素瘤小鼠模型,通过免疫印迹、流式细胞术等验证 APOL3 对肿瘤生长及 T 细胞免疫的调控。结果显示,APOL3 高表达抑制黑色素瘤细胞功能,促进 T 细胞浸润及 IFN-γ、颗粒酶 B 分泌,提示其作为黑色素瘤免疫治疗靶点的潜力。
黑色素瘤起源于黑素细胞,具有高转移潜能,晚期患者预后差,现有靶向治疗和免疫检查点抑制剂存在耐药及副作用问题。抗原呈递作为激活 T 细胞抗肿瘤免疫的核心过程,通过 MHC 分子呈递肿瘤抗原,启动 T 细胞应答,但其在黑色素瘤中的调控机制仍需深入探索。
APOL3 属于载脂蛋白 L 家族,参与脂质代谢和免疫调节,已被报道与肾癌、白血病等相关,但其在黑色素瘤中的作用未知。基于 APOL3 与抗原呈递的关联及免疫调节特性,本研究推测:APOL3 可能通过增强抗原呈递相关的 T 细胞免疫,抑制黑色素瘤进展,为开发新疗法提供依据。
图 1:基于抗原呈递相关基因的黑色素瘤患者聚类分析
该图展示基于抗原呈递(AP)相关基因的患者分组及差异:通过对 TCGA-SKCM 数据中 56 个预后 AP 相关基因进行共识聚类,将患者分为 2 个集群(k=2);主成分分析(PCA)显示两集群差异显著(PC1 占 65.66%);生存分析表明集群 2 患者总生存率(OS)显著高于集群 1;热图显示 56 个 AP 相关基因(如 PSMD8、ERAP1)在两集群中差异表达。结果提示 AP 相关基因表达与黑色素瘤进展及预后相关。
图 2:AP 相关关键基因 APOL3 的鉴定
该图筛选并验证 APOL3 的预后价值:随机生存森林分析从 181 个生存相关基因中筛选出 34 个关键基因,APOL3 重要性排名最高且为保护因子(HR<1);TCGA 及 4 个 GEO 数据集(GSE22153 等)的生存分析显示,高 APOL3 表达患者 OS 显著更长;RT-qPCR 证实,与正常黑素细胞和 HaCaT 细胞相比,黑色素瘤细胞系(A375、A2058)中 APOL3 表达显著下调。提示 APOL3 是黑色素瘤的潜在保护因子,可作为预后标志物。
图 3:APOL3 过表达抑制黑色素瘤细胞增殖和迁移侵袭
该图验证 APOL3 对肿瘤细胞功能的影响:RT-qPCR 和 WB 证实 A375、A2058 细胞中 APOL3 过表达成功,且过表达组 Ki67(增殖标志物)表达降低;CCK-8、克隆形成及 EdU 实验显示,过表达 APOL3 显著抑制细胞活力、克隆形成能力及增殖;划痕实验和 Transwell 实验表明,过表达 APOL3 显著减少细胞迁移和侵袭,而敲低 APOL3 则呈现相反效果。证实 APOL3 可抑制黑色素瘤细胞的恶性表型。
图 4:APOL3 表达相关的基因突变景观
该图分析 APOL3 表达与基因突变的关联:高 APOL3 表达组突变率为 97.89%,低表达组为 94.03%,热图展示两组中突变率最高的 30 个基因;体细胞相互作用分析显示,两组突变基因多呈共现关系;森林图显示 CHST1、PARP9、ZNF408 等基因在高 APOL3 表达组突变概率更高(OR>1)。提示 APOL3 表达可能与黑色素瘤特定基因突变模式相关。
图 5:APOL3 的功能富集及免疫相关性分析
该图揭示 APOL3 与免疫功能的关联:GSEA 显示 APOL3 富集于适应性免疫反应、细胞因子应答等通路(NES>1.5);高 APOL3 表达组的基质评分、免疫评分及 ESTIMATE 评分显著更高;相关性分析显示 APOL3 与免疫检查点分子(CD274、PDCD1、CTLA4 等)呈正相关;免疫浸润热图表明 APOL3 表达与 T 细胞、CD8+ T 细胞等免疫细胞浸润水平相关。提示 APOL3 可能通过调控免疫反应影响黑色素瘤进展。
图 6:APOL3 过表达抑制小鼠黑色素瘤生长并促进抗肿瘤 T 细胞免疫
该图验证 APOL3 的体内作用:B16 黑色素瘤模型中,APOL3 过表达组肿瘤体积(14 天、17 天)和重量显著小于对照组;WB 显示过表达组肿瘤中 IFN-γ、颗粒酶 B 表达显著升高;免疫组化证实 APOL3 和 CD3(T 细胞标志物)表达增加;流式细胞术显示 CD3+ T 细胞比例升高,且 CD4+、CD8+ T 细胞中 IFN-γ 分泌及 CD8+ T 细胞中颗粒酶 B 表达显著增加。证实 APOL3 可通过增强 T 细胞免疫抑制黑色素瘤生长。
本研究证实,抗原呈递相关蛋白 APOL3 可通过双重机制抑制黑色素瘤:一方面,APOL3 过表达显著抑制黑色素瘤细胞的增殖、迁移和侵袭;另一方面,APOL3 通过促进抗肿瘤 T 细胞免疫(增加 CD3+ T 细胞浸润,提高 IFN-γ 和颗粒酶 B 水平),减少体内肿瘤生长。临床数据显示 APOL3 高表达与黑色素瘤患者预后良好相关,且与免疫检查点分子及免疫浸润密切相关。这些发现提示 APOL3 可能作为黑色素瘤免疫治疗的新靶点,为开发靶向策略提供了实验依据。
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