常见细胞污染类型如何辨别及预防解决方法
常见细胞污染类型如何辨别及预防解决方法:细胞培养中常见的生物污染类型有7种,分别是细菌污染,支原体污染,原虫污染,黑胶虫污染,真菌污染,病毒污染以及非细胞污染,真菌污染来源,一般是来自实验服,并且具有气候性,多雨······
发布时间:2025-05-07 17:32:04 细胞资源库平台 访问量:22
英文标题:SOX4 facilitates brown fat development and maintenance through EBF2-mediated thermogenic gene program in mice
中文标题:SOX4通过EBF2介导的产热基因程序促进小鼠棕色脂肪的发育和维持
发表期刊:《Cell death and differentiation》
影响因子:13.7
作者单位:
细胞应激生物学国家重点实验室,细胞信号网络创新中心,教育部分子诊断工程研究中心
厦门大学附属第一医院厦门心血管病研究所心脏电生理重点实验室
厦门大学医学院健康与医学数据科学国家研究所
中国科学院深圳先进技术研究院
作者信息:
Shuai Wang;Ting He;Ya Luo;Kexin Ren;Huanming Shen;Lingfeng Hou;Yixin Wei;Tong Fu;Wenlong Xie;Peng Wang;Jie Hu;Yu Zhu;Zhengrong Huang;Qiyuan Li;Weihua Li;Huiling Guo;Boan Li
棕色脂肪的研究
大量研究表明,代谢活跃的棕色脂肪存在于婴儿和成人中,并且人类BAT活动的增加与体重下降相关。因此,促进BAT的发展和功能可能是对抗肥胖及相关代谢紊乱的一种有前途的策略。
棕色脂肪的调控因子
几种转录调控因子已被证明参与了BAT的发展和功能。先前的谱系研究表明,经典的棕色脂肪细胞来源于在胚胎发育过程中表达En1、Pax3、Pax7和Myf5的多能祖细胞。在BAT发育过程中,这些祖细胞发展为前脂肪细胞,随后通过转录级联分化为棕色脂肪细胞。早期B细胞因子2(EBF2)是棕色脂肪细胞命运的关键转录调控因子。它能够招募过氧化物酶体增殖物激活受体-γ(PPARγ),这是一种在脂肪细胞分化过程中关键的转录因子,到其棕色特异性结合位点,以维持BAT身份。去除对EBF2的抑制作用可以增强白色脂肪细胞的产热潜力。最近的研究表明,EBF2增强了ERRα/PGC1α复合物的转录活性,以促进产热基因的表达并维持BAT的核心温度。这些发现表明EBF2对于棕色脂肪细胞分化和产热功能至关重要。然而,EBF2的转录调控因子仍然未知。
SOX4的作用
SRY相关高迁移率组盒转录因子4(SOX4)是Sox C家族的一员,包含高迁移率组DNA结合域(HMG-Box域)和C端转录激活域(TAD域)。它在调节细胞干性、细胞分化以及神经系统、内分泌岛和心脏的发育中起关键作用。我们发现SOX4不仅抑制WAT中的前脂肪细胞决定,而且在长期寒冷暴露期间作为PPARγ的共激活因子促进米色脂肪细胞的形成。
SOX4与棕色脂肪
尽管棕色和米色脂肪分化的调控涉及一组重叠的泛脂肪生成和BAT特异性转录在现有研究中,SOX4在决定棕色脂肪细胞命运中的潜在作用尚不明确。我们发现,SOX4通过促进Ebf2的转录,对小鼠的褐色脂肪组织发育和产热功能至关重要,这一过程可能受到PKA激活的促进。
研究意义
我们的研究揭示了SOX4在调控产热基因程序中的调节作用和机制,并表明靶向SOX4可能是对抗肥胖以提高能量消耗的一种潜在策略。
实验动物与饲养条件
小鼠种类为C57BL/6遗传背景的雄性,在22–24°C温度、50–60%湿度、12小时光照/黑暗周期下群居笼中饲养。
饮食条件
小鼠分别接受含67.4%碳水化合物、20.6%蛋白质、12%脂肪的普通饮食,或含20%碳水化合物、20%蛋白质、60%脂肪的高脂饮食。
免疫组化和免疫荧光
使用HE染色、免疫荧光和免疫组化技术对小鼠组织进行染色和观察,以研究特定蛋白的表达和定位。
透射电子显微镜
通过透射电子显微镜技术观察小鼠BAT组织的超微结构。
身体成分分析
使用Echo MRI组成分析仪评估小鼠的脂肪和瘦肉质量。
红外热成像和耐寒测试(CTT)
通过红外热成像和耐寒测试来评估小鼠的体温调节能力。
基因表达分析
使用定量PCR和RNA-Seq技术分析小鼠组织中基因的表达水平。
细胞培养与脂肪细胞分化
在体外培养小鼠BAT前脂肪细胞,并通过特定培养基诱导其分化为成熟的棕色脂肪细胞。
油红O染色和甘油三酯测量
通过油红O染色观察细胞内脂滴的形成,并测量甘油三酯水平以评估脂肪细胞的脂肪积累。
棕色脂肪细胞氧消耗率(OCR)测定
使用XF96 Extracellular Flux Analyzer测定分化后的棕色脂肪细胞的氧消耗率,以评估其代谢活性。
腺病毒的构建、纯化和注射
构建并纯化携带Sox4基因的腺病毒,并将其注射到小鼠BAT中以实现SOX4的过表达。
腺相关病毒(AAV)的包装和纯化
构建并纯化携带SOX4基因的腺相关病毒,通过尾静脉注射到小鼠体内以实现SOX4的过表达。
荧光素酶报告基因实验
构建荧光素酶报告基因质粒,通过转染细胞和测定荧光素酶活性来研究基因启动子的活性。
染色质免疫沉淀(ChIP)和ChIP测序分析
通过ChIP技术结合高通量测序分析SOX4蛋白在基因组中的结合位点。
Sox4-MKO小鼠构建:通过Myf5-Cre小鼠与Sox4f/f小鼠交配,特异性地在BAT中敲除Sox4基因。
SOX4蛋白水平降低:Sox4-MKO小鼠的BAT、iWAT和gWAT中SOX4蛋白水平显著降低。
BAT形态学改变:Sox4-MKO小鼠的BAT组织形态发生改变,脂滴大小显著减小。
胚胎BAT发育异常:E15.5 Sox4-MKO胚胎的肩胛间BAT区域发育异常,SOX4和UCP1表达降低。
ob/ob小鼠BAT变化:ob/ob小鼠BAT中SOX4和UCP1蛋白及mRNA水平均降低。
饮食影响BAT:高脂饮食喂养的小鼠BAT中SOX4和UCP1表达降低。
年龄影响BAT:随着年龄增长,小鼠BAT中SOX4和UCP1表达降低。
Sox4-MKO新生鼠产热不足:Sox4-MKO新生鼠在冷暴露下皮肤温度降低,表明产热能力受损。
Sox4-MKO成鼠体温调节受损:Sox4-MKO成鼠在冷暴露后核心体温下降,血糖和血清游离脂肪酸水平升高,BAT中甘油三酯含量降低。
Sox4-MKO成鼠能量代谢降低:Sox4-MKO成鼠在冷暴露下氧消耗和热量产生降低,对β3-肾上腺素能受体激动剂的反应减弱。
Sox4-BKO新生鼠产热不足:Sox4-BKO新生鼠在冷暴露下皮肤温度降低,表明产热能力受损。
Sox4-BKO成鼠体温调节受损:Sox4-BKO成鼠在冷暴露后核心体温下降,血糖和血清游离脂肪酸水平升高,BAT中甘油三酯含量降低。
Sox4-BKO成鼠能量代谢降低:Sox4-BKO成鼠在冷暴露下氧消耗和热量产生降低。
Sox4-MKO小鼠对高脂饮食更易感:Sox4-MKO小鼠在高脂饮食喂养下体重增加更多,显示出对肥胖的易感性。
葡萄糖耐量受损:Sox4-MKO小鼠在葡萄糖耐量测试中血糖水平更高,表明葡萄糖代谢受损。
胰岛素耐量受损:Sox4-MKO小鼠在胰岛素耐量测试中血糖水平更高,表明胰岛素敏感性降低。
脂肪质量和分布改变:Sox4-MKO小鼠的脂肪质量和瘦肉质量比例改变,BAT、iWAT、gWAT和肝脏的重量与体重比例增加。
脂肪组织形态学改变:Sox4-MKO小鼠的脂肪组织显示脂滴增大,炎症标记物F4/80表达增加。
代谢活动降低:Sox4-MKO小鼠的食物摄入量、运动活动、氧消耗和产热均降低,表明整体代谢活动下降。
Sox4-MKO小鼠BAT超微结构改变:透射电子显微镜显示Sox4-MKO小鼠的BAT中线粒体数量减少,脂滴增大。
线粒体蛋白表达降低:免疫荧光和qPCR分析显示Sox4-MKO小鼠BAT中TOM20和线粒体DNA的转录本表达降低。
RNA测序揭示基因表达变化:RNA测序和热图分析显示Sox4-MKO小鼠BAT中大量基因表达下调,包括线粒体功能和脂肪代谢相关基因。
线粒体功能基因表达降低:RT-PCR分析显示Sox4-MKO小鼠BAT中线粒体复合物基因表达降低。
BAT特异性基因表达降低:RT-PCR分析显示Sox4-MKO小鼠BAT中多个BAT特异性基因表达降低。
蛋白水平降低:Western blot分析显示Sox4-MKO小鼠BAT中SOX4、线粒体呼吸链成分、BAT特异性蛋白和AGT蛋白的表达降低。
Sox4在棕色脂肪细胞分化中的必要性:通过慢病毒介导的shRNA技术,在体外抑制Sox4表达,发现Sox4对于棕色脂肪细胞的分化是必需的。
Sox4缺失影响脂肪积累:Sox4缺失导致分化后的棕色脂肪细胞中脂滴减少,甘油三酯含量降低。
BAT特异性基因表达降低:Sox4缺失导致棕色脂肪细胞中BAT特异性基因的mRNA水平显著降低。
WAT特异性基因表达增加:Sox4缺失导致棕色脂肪细胞中WAT特异性基因的mRNA水平增加。
蛋白水平降低:Sox4缺失导致棕色脂肪细胞中BAT富集蛋白和AGT蛋白的表达降低。
线粒体数量减少:Sox4缺失导致棕色脂肪细胞中线粒体DNA的转录本表达降低。
氧消耗率降低:Sox4缺失导致棕色脂肪细胞的氧消耗率降低,表明其代谢活性下降。
RNA测序与基因本体分析:RNA测序数据显示Sox4-MKO和Ebf2-AKO BAT中重叠下调基因,基因本体分析揭示与BAT发育相关基因显著下调。
ChIP测序结果:ChIP测序显示SOX4在Ebf2启动子上游-4k处显著富集结合,表明直接调控关系。
ChIP分析:ChIP分析证实SOX4蛋白在BAT SVF中Ebf2启动子上游-4k处有显著占用。
萤光素酶活性实验:NIH3T3细胞中,SOX4转染显著增强野生型pGL4.26-EBF2载体的萤光素酶活性,突变载体无此效应。
Ebf2启动子转录活性:NIH3T3细胞中,SOX4显著提高Ebf2启动子的相对转录活性,ΔHMG和ΔTAD突变体活性降低。
FAIRE实验:BAT SVF细胞感染shSOX4慢病毒后,Ebf2启动子区域的染色质开放性降低。
免疫荧光分析:E15.5 Sox4f/f和Sox4-MKO胚胎中,Sox4-MKO胚胎的EBF2表达显著降低。
UMAP图:E10.5到E13.5小鼠胚胎间充质和骨骼肌细胞的UMAP图显示BAT发育区域的细胞簇。
发育阶段细胞突出显示:UMAP图中根据发育阶段起源突出显示细胞。
Sox4和Ebf2表达模式:不同细胞簇中Sox4和Ebf2的表达模式显示其相关性。
平均表达水平:E10.5到E13.5小鼠胚胎中Ebf2和Sox4的平均表达水平显示其协同变化。
人类iPSCs分化表达:人类iPSCs分化为棕色脂肪细胞过程中,Sox4和Ebf2的mRNA表达水平同步变化。
免疫染色实验:BAT SVF细胞在不同培养基中处理1小时后,免疫染色显示SOX4的核定位变化。
ChIP-Seq分析:对照组和3X HA-SOX4表达的BAT SVF细胞在不同培养基中处理,ChIP-Seq分析显示SOX4在Ebf2启动子上的结合模式及新发基序。
免疫荧光实验:BAT SVF细胞经不同处理(DMSO、佛司可林、H89)后,佛司可林刺激显示SOX4蛋白核转位增强。
ChIP-qPCR:未处理或佛司可林处理的BAT SVF中,SOX4在Ebf2启动子上的占有率显著增加。
RT-qPCR分析:Sox4-MKO和对照小鼠的BAT SVF细胞经佛司可林处理后,Ebf2 mRNA水平显著变化。
冷暴露实验:Sox4f/f和Sox4-MKO小鼠在冷暴露后,BAT中Ebf2的表达水平显著不同。
萤火虫报告基因实验:不同处理的BAT SVF细胞中,Ebf2增强子的转录活性显著变化。
质谱分析:HEK293T细胞共转染WT-PRKACA或KD-PRKACA与HA-SOX4,质谱分析显示SOX4磷酸化位点。
氨基酸残基比对:不同物种SOX4残基S325及其相邻氨基酸残基的比对。
免疫荧光实验:NIH3T3细胞转染Flag-SOX4(WT或S235A突变体),佛司可林处理后SOX4核转位变化。
qPCR分析:NIH3T3细胞转染Flag-SOX4(WT或S235A突变体),佛司可林处理后Ebf2 mRNA水平变化。
机制图解:佛司可林诱导PKA激活,SOX4在S235处磷酸化,核转位后与EBF2合作激活EBF2转录。
免疫荧光分析:SOX4和EBF2在成熟BAT脂肪细胞核中共定位,提示功能相互作用。
免疫沉淀和Western blot分析:抗SOX4抗体免疫沉淀验证了SOX4与EBF2的物理结合。
ChIP实验:SOX4在Ucp1和Prdm16基因启动子区域显著占有率,表明直接转录调控。
FAIRE实验:Sox4-BKO小鼠在Ucp1和Prdm16启动子上游区域的DNA富集减少,影响染色质开放状态。
转录活性评估:SOX4和EBF2共同过表达显著增强Ucp1和Prdm16启动子的转录活性。
示意图模型:冷刺激或福司可林激活PKA,磷酸化SOX4促进核定位,与EBF2协同增强产热基因转录。
1. SOX4对BAT发育和产热的重要性
SOX4是BAT发育和产热程序的必需因子。
Sox4-MKO和Sox4-BKO小鼠在冷暴露时出现BAT变白和体温过低。
2. Sox4-MKO小鼠的产热能力降低
Sox4-MKO小鼠产热能力下降,易受饮食诱导的肥胖影响。
3. SOX4过表达增强产热
BAT中过表达SOX4可增强产热,对抗饮食诱导的肥胖。
4. SOX4通过激活EBF2转录调控棕色脂肪命运
SOX4通过激活EBF2的转录决定棕色脂肪细胞的命运。
5. PKA磷酸化SOX4促进核内转移和EBF2转录
PKA在S235位点磷酸化SOX4,促进其核转位和EBF2的转录。
6. SOX4与EBF2合作激活产热基因转录程序
SOX4与EBF2共同激活调控产热基因表达的转录程序。
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