常见细胞污染类型如何辨别及预防解决方法
常见细胞污染类型如何辨别及预防解决方法:细胞培养中常见的生物污染类型有7种,分别是细菌污染,支原体污染,原虫污染,黑胶虫污染,真菌污染,病毒污染以及非细胞污染,真菌污染来源,一般是来自实验服,并且具有气候性,多雨······
发布时间:2026-06-17 17:16:59 细胞资源库平台 访问量:15
视网膜退行性疾病(RDs,如年龄相关性黄斑变性、视网膜色素变性)因感光细胞丢失导致失明,全球数百万患者缺乏有效治疗手段。人视网膜祖细胞(RPCs) 因具备自我更新及分化为所有视网膜细胞的能力,是 RDs 细胞治疗的理想供体细胞,但存在两大瓶颈:一是人胎儿视网膜来源的 RPCs 伦理争议大、数量有限;二是缺乏特异性细胞表面标志物,难以高效分选纯净 RPCs(传统动物来源标志物如 CD24、KIT 在人类中不特异)。
中山大学的团队 在《Stem Cell Research & Therapy》上发表题为Dynamic molecular and cellular characteristics of VSX2-positive retinal progenitor cells in human retinal organoids的研究,利用 VSX2 增强绿色荧光蛋白(eGFP)报告基因人诱导多能干细胞(hiPSC)系,构建视网膜类器官(ROs),追踪 VSX2⁺RPCs 的时空动态,通过转录组分析揭示其异质性,并首次筛选出 394 个 CD 标志物的动态表达,发现TNFRSF1B为早期 RPCs 的新候选表面标志物,为 RPCs 的临床转化奠定基础。
hiPSC 培养与视网膜类器官(ROs)构建:采用 4 株 hiPSC(BC1、VSX2-eGFP、BRN3B-GFP、UC3X18),在 Matrigel 包被板上用 mTeSR1 培养基维持 pluripotency;ROs 分化按已发表 protocol 进行:hiPSCs 诱导至 D12 形成眼场样结构(EFs),D14-D30 发育为视杯样结构(OCs,含神经视网膜 NR 与视网膜色素上皮 RPE),D30 后手动剥离 OCs 形成 ROs,培养至 D225,定期观察 VSX2-eGFP 荧光。
VSX2-eGFP 报告基因验证与细胞分选:通过免疫荧光(抗 VSX2 抗体)验证 eGFP 与内源性 VSX2 的共定位;在 D28(极早期)、D55(早期)、D118(中期)、D170(晚期)用木瓜蛋白酶解离 ROs 的 NR,通过荧光激活细胞分选(FACS)分离 VSX2-eGFP⁺/⁻细胞,分选缓冲液为含 1mM EDTA 和 2% FBS 的 PBS,4℃分选。
转录组分析与标志物筛选:对分选细胞进行 bulk RNA-seq(Illumina NovaSeq 6000),用 HISAT2 比对基因组,StringTie 组装转录本,DESeq2 分析差异表达基因(DEGs,FDR<0.05、|FC|≥2),GSEA 分析通路富集;重点分析 394 个人类 CD 标志物的动态表达,结合 FPKM 值(>5 为高表达)与免疫荧光 / 流式验证候选标志物。
免疫荧光与流式细胞术验证:ROs 或分选细胞固定后,用 RPC 标志物(RAX、SOX9、PAX6)、增殖标志物(Ki67、MCM2)、双极细胞标志物(PKCα)及候选 CD 标志物(TNFRSF1B)的抗体染色,共聚焦显微镜观察;流式细胞术(LSRFortessa)量化 TNFRSF1B 与 VSX2/Ki67 的共表达率。

图1:VSX2-eGFP 报告基因的时空表达与可靠性验证
该图证实 VSX2-eGFP 可忠实反映内源性 VSX2 表达:(A)RT-qPCR 显示 VSX2-eGFP hiPSC 与亲本 BC1 hiPSC 的多能性基因(OCT4、NANOG)表达一致;(B)D60 ROs 的转录组相关性(Pearson 系数 0.997),视网膜谱系基因(VSX2、RAX、LHX2)表达无差异,排除基因编辑的负面影响;(C-D)荧光观察显示:D12-D14 eGFP 在 EFs 中首次出现,D14-D30 在 OCs 的中央 NR 区特异性表达(RPE 无表达),D30 后 ROs 的 NR 层持续表达,D90-D225 荧光密度逐渐降低;(E)免疫荧光证实 eGFP 与内源性 VSX2 共定位,仅 D55 NR 最内层有短暂 eGFP 信号(可能因荧光蛋白稳定性高于内源蛋白),随成熟消失,验证报告基因的可靠性。

图2-4:VSX2-eGFP⁺细胞的阶段特异性特征(极早期→晚期)
图2(极早期,D28):VSX2-eGFP⁺细胞含 245 个特异表达基因(SEGs),1735 个 DEGs,高表达 RPC 标志物(VSX2、RAX、HES1),低表达脑发育基因(FOXG1、SOX1)与 RPE 基因(OTX2、BEST1);免疫荧光显示 D16 EF 中 eGFP⁺细胞 90% 以上表达 RAX,不表达 SOX1/OTX2,证实为 RPCs。

图3(早期,D55):eGFP⁺细胞含 548 个 SEGs,3550 个 DEGs,高表达 RPC 基因(SOX9、SOX2)与增殖基因(MKI67、PCNA),低表达视网膜神经节细胞(ATOH7)与感光细胞(CRX)基因;免疫荧光显示 eGFP⁺细胞 85% 以上表达 MCM2/Ki67(增殖)与 RAX/SOX9(RPC),为增殖型 RPCs。

图4(晚期,D170):eGFP⁺细胞含 784 个 SEGs,4182 个 DEGs,高表达双极细胞基因(PCP2、VSX1)与 Müller 胶质细胞基因(GLUL),低表达感光细胞 / 无长突细胞基因;免疫荧光显示 eGFP⁺细胞位于 NR 的内核层,不表达 Ki67/RAX,90% 以上表达双极细胞标志物 PKCα,证实分化为双极细胞。

图5:VSX2-eGFP⁺细胞的转录组异质性
该图揭示 RPCs 的阶段特异性转录差异:(A)VSX2 在 D28-D118 表达稳定,D170 显著降低;(B)各阶段 SEGs 不同:D28 富集 LIN28A(干细胞相关),D55 富集 ONECUT1(早期细胞命运),D118 富集 PRDM13(神经发生),D170 富集 SLC4A10(双极细胞功能);(C-F)DEGs 与通路分析:D55 vs D28 富集细胞周期 / DNA 复制通路,D118 vs D55 富集光传导 / 谷氨酸突触通路,D170 vs D118 富集突触囊泡循环通路;(G)细胞命运基因动态:D28-D55 高表达早期细胞(神经节细胞、无长突细胞)基因,D55 后高表达晚期细胞(视杆、双极细胞)基因,反映 RPCs 分化潜能的时空变化。

图6:CD 标志物筛选与 TNFRSF1B 的鉴定
该图首次解析 394 个 CD 标志物的动态表达并发现新 RPC 标志物:(A)127 个差异表达 CD 标志物(DECDGs)分阶段富集:D28 富集增殖 / 迁移相关(CD24、TNFRSF1B),D55 富集形态发生相关(IFITM1),D118 富集神经发生相关(NCAM1),D170 富集整合素家族(ITGA1/2);(B)D28/D55 eGFP⁺细胞中,TNFRSF1B 显著上调(FPKM>5),而传统动物来源标志物(CD24、FUT4、CD44、KIT)无特异性(CD24 在 eGFP⁻细胞也高表达,KIT 在神经节细胞中也存在);(C-G)验证:免疫荧光显示 TNFRSF1B 与 eGFP⁺细胞共定位(D32),D35-D55 NR 中高表达,D75 后降低;流式显示 D55 NR 中 92±5% VSX2⁺细胞、86±7% Ki67⁺细胞表达 TNFRSF1B,证实其为早期 RPCs 的候选标志物。
本研究的核心贡献的在于:1)模型创新:建立 VSX2-eGFP 报告基因 hiPSC-RO 系统,首次实现人类 RPCs 的时空动态追踪,验证其可忠实反映内源性 VSX2 表达;2)机制发现:揭示 VSX2⁺细胞的阶段特异性特征 —— 极早期 / 早期为增殖型 RPCs,晚期分化为双极细胞,且存在显著转录异质性,为选择移植用 RPCs(推荐 D28-D55)提供依据;3)标志物突破:首次系统分析 394 个 CD 标志物的动态表达,发现 TNFRSF1B 为早期 RPCs 的新特异性标志物(传统标志物如 CD24/KIT 无特异性),流式验证共表达率超 90%,解决 RPCs 分选难题。
局限性在于:D55 NR 最内层存在短暂 eGFP 信号,可能轻微影响分选纯度;未来需结合单细胞 RNA-seq 细化 RPC 亚群,并用 TNFRSF1B 分选 RPCs 验证移植疗效。该研究为视网膜发育研究与 RDs 细胞治疗提供关键工具与理论基础。
常见细胞污染类型如何辨别及预防解决方法:细胞培养中常见的生物污染类型有7种,分别是细菌污染,支原体污染,原虫污染,黑胶虫污染,真菌污染,病毒污染以及非细胞污染,真菌污染来源,一般是来自实验服,并且具有气候性,多雨······
细胞聚团的原因分析及如何避免:培养物中细胞可能聚集的一些原因包括:1.过度消化、2.环境压力、3.组织分解、4.过度生长、5.污染等;如何避免聚团细胞的生成;首先确认当前细胞生长密度及状态,80%左右的生长密度即可进行······
细胞有空泡原因分析及解决方法:出现细胞空泡情况有1.细胞老化2.培养液错误配制;3.细胞消化时操作不当;4.污染等等,如细胞老化,解决方法,原代细胞使用较低代次进行实验,传代细胞避免传代次数过高···
细胞半换液和全换液操作步骤:第一种方式:细胞全换液;如果是贴壁细胞,可以用全量换液法,直接吸去全部旧培养基,补充足量新鲜完全培养基;第二种方式:细胞半换液;"细胞半换液"又称"细胞半量换液",即弃掉一半旧的培养基,再······
细胞生长缓慢的可能原因有哪些:细胞培养外部因素包括细胞培养基的配方和质量问题,培养条件不理想,污染问题,细胞自身因素包含细胞的健康状态,细胞密度过高或过低,细胞老化现象,细胞特性,当细胞生长出现缓慢的问题时,我······
常用胰腺癌细胞株动物模型及胰腺癌细胞株有哪些:胰腺癌研究中常用的动物模型主要包括化学物质诱导胰腺癌动物模型,基因工程胰腺癌小鼠模型和胰腺癌移植模型,常用的胰腺细胞株MIA-PACA-2人胰腺癌细胞,Capan-2人胰腺癌细······
产品规格:1*10^6
¥3000
产品规格:1*10^6
¥3000
产品规格:1*10^6
¥3000
产品规格:1*10^6
¥3000
上一篇:CRISPR 新技术实现肺癌 EGFR 突变低成本可视化检测
下一篇:基于恶性胸腔积液的肺腺癌 2.5D 类器官平台:精准药敏与肿瘤 - 免疫 - 基质建模