常见细胞污染类型如何辨别及预防解决方法
常见细胞污染类型如何辨别及预防解决方法:细胞培养中常见的生物污染类型有7种,分别是细菌污染,支原体污染,原虫污染,黑胶虫污染,真菌污染,病毒污染以及非细胞污染,真菌污染来源,一般是来自实验服,并且具有气候性,多雨······
发布时间:2026-03-15 17:13:39 细胞资源库平台 访问量:159
猪胎盘为上皮绒毛膜型(无侵袭性,母胎血管间保留完整组织层),其母胎界面存在独特的乳晕结构(areola,负责母源组织液转运),但猪滋养层细胞异质性及分化机制尚不明确。现有模型(如 PTr2 细胞系)仅模拟早期滋养层,无法复现体内异质性,且缺乏体外模型研究母胎互作。本研究通过建立猪滋养层类器官(sTOs),结合 Visium 空间转录组,解析猪母胎界面的细胞多样性、分化轨迹及细胞互作,填补猪胎盘体外研究的空白,为兽医生殖生物学及比较胎盘学提供工具。
来自美国杜克大学、北卡州立大学、普渡大学的团队在《PLOS Biology》(2025 年,Vol. 23)发表题为Defining cellular diversity at the swine maternal–fetal interface using spatial transcriptomics and organoids的研究。
(1)研究方法
猪滋养层类器官(sTOs)构建与培养:从足月猪胎盘分离组织,经胰蛋白酶 - 胶原酶两步消化获得滋养层祖细胞,用 Matrigel 包裹形成 “穹顶”,在 tTOM 培养基(含 EGF、FGF2、CHIR99021 等)中培养,5-7 天传代,可冷冻复苏;悬浮培养 48 小时实现极性反转( apical 面从内侧转向外侧),模拟体内极性。
分子与空间解析:单细胞 RNA-seq 分析 3 株 sTOs 的细胞异质性;对妊娠 66 天猪母胎界面样本进行 Visium 空间转录组,定位 10 个细胞集群;免疫荧光验证标志物(增殖 marker MKI67、上皮 marker CK18、紧密连接 ZO-1);CellChat 分析细胞互作网络;Slingshot 分析 sTOs 分化轨迹;整合单细胞与空间数据,通过概率建模匹配 sTOs 集群与体内细胞类型。
功能验证:差异表达分析与 GO 富集验证 sTOs 与体内细胞的功能一致性;比较 sTOs 与猪胎盘组织、子宫组织、PTr2 细胞的转录组差异;检测 sTOs 对乳晕滋养层特异性功能(内体形成)与界面滋养层功能( focal adhesion、血管生成)的保留。
(2)关键结果
sTOs 可长期培养(>15 代),保留胎儿来源(Y 染色体基因检测),高表达滋养层标志物(KRT18、GATA3、CTSB),无子宫或成纤维细胞污染(低表达 FOXA2、VIM),极性可通过悬浮培养反转;单细胞 RNA-seq 显示 sTOs 含 5 个集群:增殖型滋养层(TOP2A+)、界面滋养层(CA4+、PAG2L4+)、乳晕滋养层(CTSL+,分 2 亚型)、炎症相关滋养层(CXCL8+)、COX 酶高表达滋养层;Visium 空间转录组将母胎界面分为 10 个集群,母方包括肌层(SMTN+)、子宫内膜(SLPI+),胎方包括界面滋养层(PSGs+)、乳晕滋养层(Areola-1:CTSLhigh/SPINK4+;Areola-2:CTSLmed/MMP7+),且发现 Areola-1 不与界面滋养层连续,可能为成熟亚型;整合分析显示 sTOs 集群与体内细胞高度匹配(如 sTO 集群 0 对应界面滋养层,集群 1/3 对应 Areola-2),且保留核心功能(界面滋养层富集血管生成通路,Areola-2 富集内体通路);CellChat 证实 sTOs 与体内共享 28 条细胞互作通路(如 ANGPTL、CDH、AGRN),界面滋养层为主要信号发送者,乳晕滋养层为接收者,模拟体内母胎互作;Slingshot 轨迹显示 sTOs 从增殖型滋养层分化为界面滋养层,最终分化为 Areola-2,关键基因(TOP2A 下调、GRN/ITM2C 先升后降、NUPR1 上调)与体内一致。

图 1:猪滋养层类器官(sTOs)的建立与验证
该图展示 sTOs 构建核心流程与特性:(A)流程:足月胎盘消化→Matrigel 培养→sTOs 形成;(B-D)形态:Matrigel 中为致密球形(无中央腔,与人类类器官差异),悬浮培养呈囊状;(E-G)免疫荧光:sTOs 表达增殖 marker MKI67、上皮 marker CK18、紧密连接 ZO-1(Matrigel 中内侧定位,悬浮后外侧定位);(J-K)转录验证:sTOs 含 Y 染色体基因(确认胎儿来源),高表达胎盘标志物(如 PAGE4、CTSD),低表达子宫 / 成纤维细胞标志物。图示证实 sTOs 的滋养层属性与极性可塑性。

图 2:sTOs 的单细胞异质性解析
该图揭示 sTOs 的细胞多样性:(A)UMAP 显示 5 个集群,分布一致 across 3 株 sTOs;(C-D)标志物表达:滋养层 marker(KRT7、GATA2)高表达,成纤维细胞 / 子宫 marker(VIM、FOXA2)低表达;(E-F)集群特征:集群 2(增殖型,TOP2A+)、集群 0(界面滋养层,SOX5+)、集群 1(Areola-2,OCLN+)、集群 3(炎症相关,CXCL8+)、集群 4(COX 酶高表达);(G)泛滋养层 marker CTSB/KRT18 均匀表达,证实均为滋养层亚型。图示明确 sTOs 的异质性,为后续匹配体内细胞奠定基础。

图 3:猪母胎界面的空间转录组解析
该图定位母胎界面的细胞分布:(A)流程:妊娠 66 天母胎界面样本→OCT 包埋→Visium 测序;(B-D)UMAP 与 H&E 匹配:10 个集群对应组织学结构,母方肌层(Myo-1/2)、子宫内膜(Endo),胎方界面滋养层(IntTroph)、乳晕滋养层(Areola-1/2);(C-F)标志物定位:肌层高表达 SMTN,子宫内膜高表达 SLPI,界面滋养层高表达 PSGs,Areola-1 高表达 CTSL;(G-H)样本一致性:4 个样本集群比例相似,Areola-1 与界面滋养层不连续。图示首次实现猪母胎界面的空间转录组图谱,明确胎方细胞的组织学定位。

图 4:空间转录组发现的滋养层特异性标志物
该图筛选胎方细胞的专属 marker:(A-B)泛滋养层 marker CTSZ/CTSB 在界面与乳晕均高表达,界面滋养层专属 CA4/PAG2L4,Areola-1 专属 CCDC162/SPINK4,Areola-2 专属 MMP7/AGR2;(C)sTOs 中这些 marker 分集群表达,如 CA4 在集群 0 高表达,CTSL 在集群 1/3 高表达。图示为滋养层亚型鉴定提供特异性标志物,且验证 sTOs 保留亚型特征。

图 5:猪母胎界面的细胞互作网络
该图分析母胎信号交流:(A-B)肌层与血管为主要信号发送者,胎方滋养层信号较弱;(C)信号模式:母方以 OSTN/VEGF 信号为主,胎方以 HGF/EGF 信号为主;(D-L)关键通路:HSPG2(肌层→界面滋养层,促血管生成)、MK(乳晕→母方 / 胎方,促滋养层功能)、IL6(界面滋养层→子宫内膜,免疫调节),且存在胎方内部互作(界面→乳晕)。图示揭示猪母胎界面的双向信号网络,为理解胎盘功能调控提供依据。

图 6:sTOs 与空间数据的整合匹配
该图建立 sTOs 与体内细胞的对应关系:(A-C)空间数据筛选胎方集群(IntTroph、Areola-1/2);(D-E)概率建模:sTO 集群 0 匹配 IntTroph(概率 > 0.8),集群 1/3 匹配 Areola-2,集群 4 匹配 Areola-1;(F-G)共享标志物:sTO 集群 0 与 IntTroph 共享 AKR1B1/TGM2,集群 1 与 Areola-2 共享 CTSA/NUPR1;(H)集群比例:sTOs 各亚型比例与体内一致。图示证实 sTOs 可模拟体内滋养层异质性,为体外研究提供有效性依据。

图 7:sTOs 的分化轨迹分析
该图追溯滋养层分化路径:(A)Slingshot 轨迹:从增殖型滋养层(ProfTroph)→界面滋养层(IntTroph)→Areola-2,为单一分化路径;(B-C)基因动态:增殖基因(TOP2A、HMGB2)随分化下调,界面特异性基因(GRN、ITM2C)先升后降,Areola-2 特异性基因(NUS1、NUPR1)终末上调;(D-F)空间验证:这些基因在体内对应细胞中表达模式一致(如 GRN 在界面滋养层高表达)。图示明确猪滋养层的分化顺序,为研究分化调控提供体外模型。

图 8:sTOs 与体内的细胞互作对比
该图验证 sTOs 对体内互作的保留:(A)Venn 图:sTOs 与体内共享 28 条滋养层互作通路;(B)信号强度:界面滋养层均为主要发送者,乳晕为接收者;(G-N)关键通路:ANGPTL(自分泌 / 旁分泌,整合素介导)、CDH(乳晕自分泌,界面无自分泌)、AGRN(界面专属,DAG1 为受体)在 sTOs 与体内模式一致。图示证实 sTOs 可复现体内滋养层互作,具备生理相关性。
本研究的核心贡献在于:1. 建立首个可长期培养、极性可控的猪滋养层类器官(sTOs),高保真模拟体内滋养层异质性;2. 首次绘制猪母胎界面的空间转录组图谱,鉴定 10 个细胞集群及乳晕滋养层的 2 个功能亚型;3. 整合单细胞与空间数据,明确 sTOs 集群与体内细胞的对应关系,证实其保留核心功能(内体形成、血管生成)与细胞互作通路(ANGPTL、CDH);4. 揭示猪滋养层从增殖型→界面→乳晕的分化轨迹,为胎盘发育研究提供新机制。局限性包括:Visium 空间分辨率无法达到单细胞水平,仅分析妊娠 66 天样本(缺乏多时序动态);未来需结合更高分辨率空间技术(如 STORM)及不同妊娠阶段样本,优化 sTOs 的成熟度(如模拟 syncytiotrophoblast 形成)。该研究为猪生殖健康、胎儿发育及比较胎盘学提供关键工具,也为人类胎盘研究提供参考(如乳晕与人类胎盘转运结构的进化关联)。
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