常见细胞污染类型如何辨别及预防解决方法
常见细胞污染类型如何辨别及预防解决方法:细胞培养中常见的生物污染类型有7种,分别是细菌污染,支原体污染,原虫污染,黑胶虫污染,真菌污染,病毒污染以及非细胞污染,真菌污染来源,一般是来自实验服,并且具有气候性,多雨······
发布时间:2023-05-08 17:37:53 细胞资源库平台 访问量:287
全称:澳大利亚细胞培养物保藏中心
官网:http://www.cellbankaustralia.com/
细胞查询链接:http://www.cellbankaustralia.com/ecacc-cell-lines
CellBank Australia 是一个由位于悉尼韦斯特米德的儿童医学研究所运营的非盈利组织,是澳大利亚唯一的国家细胞系储存库,为澳大利亚科学家提供了获取经过验证的细胞系和相关质量控制服务的便捷途径。
CellBank Australia 还在整个澳大利亚和新西兰分发来自英国公共卫生部欧洲认证细胞培养物保藏中心 (ECACC) 的细胞系,这是一个位于英国的主要国际细胞系储存库,以及来自日本研究生物资源保藏中心 (JCRB) 的细胞系,这两个集合还包括许多 ATCC 细胞系。这确保了澳大利亚科学家可以随时使用各种经过验证的细胞系
CellBank Australia 提供多种细胞系相关服务,包括 STR 分析、支原体检测、培养和返回以及安全存储。
一、细胞系认证测试
细胞系的交叉污染(一种细胞系被另一种细胞系污染)是细胞培养中的常见问题。1960 年代首次与 HeLa 细胞系相关联,交叉污染在各种研究中估计会影响 13% 到 36% 的现有细胞系。虽然使用从存储库和良好细胞培养规范获得的经过验证的细胞系可以最大限度地降低交叉污染的风险,但它仍然会发生。因此,研究实验室定期测试其细胞系的交叉污染非常重要。
1、人类细胞系认证测试
为什么要进行 STR 分析?
认证测试旨在确认或验证细胞系的身份,证明它来自正确的物种和供体。细胞系可能因交叉污染、错误标记或其他机制而被错误识别。存在超过 450 个错误识别的细胞系,但没有已知的真实材料。
许多期刊现在要求作者在提交手稿之前验证细胞系,并在手稿文本中报告测试。
短串联重复 (STR) 分析被用作一致的测试方法,允许实验室和期刊比较细胞系样本。STR 分析是一种基于基因型的方法,用于确定细胞系是否对应于来自同一供体的其他样本。许多细胞系没有其他供体样本进行比较。然而,STR 配置文件数据库可用于排除与 HeLa 和其他经典肿瘤细胞系的交叉污染。
CellBank Australia 的 STR 分析
CellBank Australia 接受细胞沉淀和 DNA 样本进行测试。
STR 基因座使用 PowerPlex® 16HS 系统 (Promega) 进行扩增。使用 GeneMapper™ ID 软件 (ThermoFisher) 分析数据。
设施工作人员对测试样品与参考材料和数据库进行全面比较。测试样品与设施自己的数据集和人类细胞系 STR 配置文件的国际数据库进行比较。CellBank Australia 的内部数据集包含来自澳大利亚和新西兰九年测试细胞系的 1,500 多个 STR 配置文件。
价格: 每个样品166美元,不包括消费税。
2、非人类细胞系物种鉴定测试
为什么要进行物种测试?
认证测试旨在确认或验证细胞系的身份,证明它来自正确的物种和供体。
短串联重复序列 (STR) 分析可以在个体水平上识别细胞,并已用于人和小鼠细胞系。其他基于基因型的方法,例如单核苷酸多态性 (SNP) 分析,可以确定细胞系的起源菌株。STR 或 SNP 分析尚未针对所有实验室物种开发,由于近亲繁殖,数据可能难以解释。
物种检测是一种更简单的方法,可以应用于来自许多不同物种的培养细胞,包括哺乳动物、鱼类和昆虫。该技术用于检测种间交叉污染的情况。大约 10% 的已知错误识别细胞系被交叉污染或与来自不同物种的细胞混合。一种被称为“DNA 条形码”的基于序列的方法越来越多地用于物种检测,并且是细胞系的新共识方法。
CellBank Australia 的 DNA 条形码
CellBank Australia 接受细胞沉淀和 DNA 样本进行测试。
从线粒体基因细胞色素氧化酶亚基 1 (CO1) 扩增共有区域用于序列分析。数据与几个序列数据库进行比较,包括 GenBank 和生命条码数据系统 (BOLD),其中包含超过 170 万条公共记录并涵盖 176,000 种动物。
价格: 每个样品150美元,不包括消费税。
批量测试 8 个或更多样品可享受 20% 的折扣。
3、支原体检测
支原体污染细胞系是细胞培养中的常见问题。虽然公布的数字各不相同,但估计 15% 到 35% 的已建立细胞系被支原体污染。虽然良好的细胞培养实践降低了支原体污染的发生率,但它仍然会发生,并且很容易传播。此外,支原体感染可以改变细胞的各种特性,包括基因活性的变化。由于这些原因,进行细胞培养的研究实验室必须定期检测其细胞系是否存在支原体感染。有关此问题的更多信息,请参阅 质量问题:污染和无菌测试。
为什么要检测支原体?
术语“支原体”是指通常存在于细胞培养物中的一类细菌。更准确地称为软体菌,这些细菌缺乏细胞壁,使它们对常用的抗生素如青霉素产生抗药性。支原体在细胞培养过程中很容易通过液滴传播,并且可以以干燥形式存活数月。
用显微镜很难看到支原体污染,需要进行特定测试才能检测。污染会对实验工作产生深远的影响。根据存在的物种,支原体生物可以影响细胞生长、代谢、致瘤性和对化疗的反应(1, 6-7)。
CellBank Australia 的支原体检测
对培养基样品进行支原体检测。我们建议细胞在不含抗生素的培养基中生长至少两周和/或至少传代两次。采样前 3-4 天内不应更换培养基。抗生素可以抑制细菌污染,这意味着在抗生素中生长的细胞会增加假阴性结果的风险。
使用灵敏的内部 PCR 方法检测支原体 DNA,并使用内部对照检测 PCR 抑制,这会影响培养样品。
MycoAlert® 支原体检测试剂盒 (Lonza) 用作基于酶活性检测活支原体的第二种方法。
如果结果不清楚,可以使用第三种测试方法。可以使用指示细胞系进行富集,导致可能难以在原始测试样品中检测到的低水平支原体快速生长。
价格: 每个样品126美元,不包括消费税。
CellBank Australia 提供一系列与存款相关的服务,包括将细胞系转移到 CellBank Australia 以存储在我们安全的液氮存储设施中。
1、目录存款
研究科学家可以通过我们的目录存入服务将他们的新型细胞系存入 CellBank Australia,从而更广泛地用于研究目的。保藏的细胞系在供全球分发之前要经过短串联重复 (STR) 分析和其他质量控制检查,保藏者无需支付任何费用。
为什么要在 CellBank Australia 存款?
保藏者可以确保从他们的细胞系中生成 STR 谱,以确保它们确实是独一无二的。在确定该线路的未来通道是否会受到交叉污染时,这些配置文件是有价值的参考。
存款人可以将感兴趣方的细胞系请求提交给 CellBank Australia 或其分销合作伙伴。这消除了培养、冷冻和运输细胞系的需要,节省了员工成本和工作量。保藏者还可以通过使用他们保藏的细胞系来预期科学引用的增加。
CellBank Australia 细胞系的接收者同意在所有引用该材料的出版物和专利申请中承认其保藏人(或他们的发起人,如果不是同一人)。
接收者可以直接从 CellBank Australia 或欧洲认证细胞培养物保藏中心(ECACC;英国)及其渠道合作伙伴和分销商 Sigma-Aldrich(全球分销)和 Dainippon Sumito Pharma(DSP;日本)接收 CellBank Australia 的细胞系. 因此,在 CellBank Australia 位于悉尼的办公场所之外,CellBank Australia 的细胞系可从德国、日本、英国和美国的分销中心获得。
根据购买时达成的协议条款,细胞不能用于人体,未经保存人同意,不得用于商业目的。
我们的目录存放服务是免费提供的。
2、专利押金
通过我们的专利保藏服务,CellBank Australia 接受人类和动物细胞系和杂交瘤进行储存,以补充国际专利局对发明的书面披露。
CellBank Australia 的安全存储服务是研究科学家将与短期或长期异地存储部分样本相关的成本外包的一种方式,作为其主要存储的备份。该服务并非旨在取代研究科学家自己的液氮或 -80°C 冷冻库。
送往 CellBank Australia 进行安全存储的材料与存储库自己的样本一起保存在三个液氮存储系统和一个超低温冰箱中,所有这些系统都连接到一个警报系统,可连续监控存储温度。停电时,报警系统和存储系统都连接到备用发电机。储存通常低于-150 摄氏度的液氮汽相或低于-80 摄氏度的冰箱。
包含在服务中
在液氮气相中储存,储存温度始终低于 -150 摄氏度
或储存在超低温冰箱中,储存温度始终低于-80摄氏度
每周 7 天,每天 24 小时,通过带有远程警报的建筑物范围的警报系统监控存储温度
发生电源故障时基于发电机的备用电源系统
定制的、条形码驱动的数据库,用于跟踪具有唯一标识号的安瓿。
我们现在提供 10X Chromium 3' 基因表达服务。
该服务包括
细胞计数和活力处理
使用 Gel Bead-In Emulsion (GEM) 技术进行细胞分离和条形码
后 GEM RT 净化和 cDNA 扩增
基因表达文库构建,这种铬单细胞基因表达解决方案使研究人员能够
识别和表征稀有细胞类型
分析和了解细胞异质性及其对您的生物系统的影响
评估同一细胞内的 mRNA 和细胞表面蛋白表达谱
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